Ο Γενικός Διευθυντής του Ιδρύματος Αρχιεπισκόπου Μακαρίου Γ΄, δρ. Αντρέας Κ. Φυλακτού χαρακτηρίζει το Βυζαντινό Μουσείο του Ιδρύματος ως θησαυροφυλάκιο του βυζαντινού πολιτισμού: Σύμφωνα με τον δρα Φυλακτού η πρόσφατη επίσκεψη του Πάπα Βενέδικτου του 16ου στο Βυζαντινό Μουσείο Λευκωσίας είναι «ιστορικός σταθμός» όχι μόνο για το μουσείο, αλλά και για τον τόπο γενικότερα.